Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dgcr6O35347 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dgcr6O35347 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dgcr6O35347 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dgcr6O35347 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dgcr6O35347 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dgcr6O35347 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dgcr6O35347 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dgcr6O35347 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dgcr6O35347 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dgcr6O35347 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dgcr6O35347 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dgcr6O35347 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dgcr6O35347 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dgcr6O35347 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dgcr6O35347 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dgcr6O35347 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dgcr6O35347 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dgcr6O35347 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dgcr6O35347 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dgcr6O35347 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dgcr6O35347 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dgcr6O35347 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dgcr6O35347 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dgcr6O35347 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dgcr6O35347 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dgcr6O35347 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dgcr6O35347 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dgcr6O35347 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Dgcr6O35347 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dgcr6O35347 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Dgcr6O35347 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dgcr6O35347 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Dgcr6O35347 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dgcr6O35347 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dgcr6O35347 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dgcr6O35347 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dgcr6O35347 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dgcr6O35347 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dgcr6O35347 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dgcr6O35347 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Dgcr6O35347 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dgcr6O35347 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dgcr6O35347 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dgcr6O35347 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dgcr6O35347 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dgcr6O35347 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dgcr6O35347 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dgcr6O35347 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dgcr6O35347 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dgcr6O35347 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dgcr6O35347 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dgcr6O35347 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dgcr6O35347 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dgcr6O35347 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Dgcr6O35347 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dgcr6O35347 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dgcr6O35347 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dgcr6O35347 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dgcr6O35347 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dgcr6O35347 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dgcr6O35347 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dgcr6O35347 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dgcr6O35347 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dgcr6O35347 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dgcr6O35347 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dgcr6O35347 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dgcr6O35347 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dgcr6O35347 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dgcr6O35347 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dgcr6O35347 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dgcr6O35347 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dgcr6O35347 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dgcr6O35347 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Dgcr6O35347 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dgcr6O35347 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dgcr6O35347 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Dgcr6O35347 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dgcr6O35347 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Dgcr6O35347 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dgcr6O35347 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dgcr6O35347 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dgcr6O35347 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dgcr6O35347 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dgcr6O35347 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dgcr6O35347 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dgcr6O35347 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dgcr6O35347 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dgcr6O35347 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dgcr6O35347 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dgcr6O35347 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dgcr6O35347 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dgcr6O35347 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dgcr6O35347 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dgcr6O35347 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dgcr6O35347 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dgcr6O35347 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dgcr6O35347 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dgcr6O35347 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dgcr6O35347 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms