Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PrkcshO08795 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PrkcshO08795 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PrkcshO08795 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PrkcshO08795 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PrkcshO08795 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PrkcshO08795 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PrkcshO08795 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PrkcshO08795 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PrkcshO08795 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PrkcshO08795 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PrkcshO08795 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PrkcshO08795 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PrkcshO08795 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PrkcshO08795 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PrkcshO08795 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PrkcshO08795 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PrkcshO08795 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PrkcshO08795 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PrkcshO08795 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PrkcshO08795 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PrkcshO08795 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PrkcshO08795 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PrkcshO08795 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PrkcshO08795 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PrkcshO08795 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PrkcshO08795 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PrkcshO08795 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PrkcshO08795 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PrkcshO08795 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PrkcshO08795 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PrkcshO08795 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PrkcshO08795 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PrkcshO08795 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PrkcshO08795 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PrkcshO08795 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PrkcshO08795 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PrkcshO08795 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PrkcshO08795 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PrkcshO08795 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PrkcshO08795 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PrkcshO08795 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PrkcshO08795 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PrkcshO08795 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PrkcshO08795 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PrkcshO08795 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PrkcshO08795 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PrkcshO08795 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PrkcshO08795 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PrkcshO08795 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PrkcshO08795 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PrkcshO08795 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PrkcshO08795 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PrkcshO08795 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PrkcshO08795 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PrkcshO08795 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PrkcshO08795 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PrkcshO08795 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PrkcshO08795 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PrkcshO08795 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PrkcshO08795 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PrkcshO08795 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PrkcshO08795 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PrkcshO08795 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PrkcshO08795 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PrkcshO08795 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PrkcshO08795 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PrkcshO08795 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PrkcshO08795 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PrkcshO08795 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PrkcshO08795 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PrkcshO08795 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PrkcshO08795 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PrkcshO08795 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PrkcshO08795 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PrkcshO08795 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PrkcshO08795 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PrkcshO08795 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PrkcshO08795 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PrkcshO08795 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PrkcshO08795 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PrkcshO08795 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PrkcshO08795 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms