Protein–RNA interactions for Protein: O08747

Unc5c, Netrin receptor UNC5C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Unc5cO08747 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Unc5cO08747 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Unc5cO08747 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Unc5cO08747 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Unc5cO08747 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Unc5cO08747 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Unc5cO08747 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Unc5cO08747 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Unc5cO08747 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Unc5cO08747 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Unc5cO08747 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Unc5cO08747 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Unc5cO08747 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Unc5cO08747 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Unc5cO08747 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Unc5cO08747 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Unc5cO08747 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Unc5cO08747 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Unc5cO08747 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Unc5cO08747 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Unc5cO08747 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Unc5cO08747 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Unc5cO08747 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Unc5cO08747 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Unc5cO08747 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Unc5cO08747 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Unc5cO08747 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Unc5cO08747 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Unc5cO08747 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Unc5cO08747 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Unc5cO08747 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Unc5cO08747 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Unc5cO08747 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Unc5cO08747 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Unc5cO08747 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Unc5cO08747 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Unc5cO08747 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Unc5cO08747 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Unc5cO08747 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Unc5cO08747 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Unc5cO08747 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Unc5cO08747 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Unc5cO08747 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Unc5cO08747 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Unc5cO08747 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Unc5cO08747 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Unc5cO08747 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Unc5cO08747 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Unc5cO08747 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Unc5cO08747 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Unc5cO08747 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Unc5cO08747 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Unc5cO08747 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Unc5cO08747 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Unc5cO08747 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Unc5cO08747 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Unc5cO08747 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Unc5cO08747 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Unc5cO08747 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Unc5cO08747 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Unc5cO08747 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Unc5cO08747 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Unc5cO08747 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Unc5cO08747 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Unc5cO08747 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Unc5cO08747 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Unc5cO08747 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Unc5cO08747 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Unc5cO08747 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Unc5cO08747 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Unc5cO08747 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Unc5cO08747 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Unc5cO08747 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Unc5cO08747 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Unc5cO08747 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Unc5cO08747 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Unc5cO08747 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Unc5cO08747 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Unc5cO08747 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Unc5cO08747 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Unc5cO08747 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Unc5cO08747 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.8 ms