Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ascl4M0QW46 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ascl4M0QW46 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ascl4M0QW46 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ascl4M0QW46 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ascl4M0QW46 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ascl4M0QW46 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ascl4M0QW46 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ascl4M0QW46 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ascl4M0QW46 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ascl4M0QW46 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ascl4M0QW46 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ascl4M0QW46 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ascl4M0QW46 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ascl4M0QW46 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ascl4M0QW46 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ascl4M0QW46 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ascl4M0QW46 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ascl4M0QW46 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ascl4M0QW46 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ascl4M0QW46 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ascl4M0QW46 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ascl4M0QW46 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ascl4M0QW46 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ascl4M0QW46 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ascl4M0QW46 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ascl4M0QW46 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ascl4M0QW46 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ascl4M0QW46 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ascl4M0QW46 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ascl4M0QW46 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ascl4M0QW46 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ascl4M0QW46 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ascl4M0QW46 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ascl4M0QW46 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ascl4M0QW46 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ascl4M0QW46 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ascl4M0QW46 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ascl4M0QW46 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ascl4M0QW46 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ascl4M0QW46 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ascl4M0QW46 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ascl4M0QW46 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ascl4M0QW46 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ascl4M0QW46 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ascl4M0QW46 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ascl4M0QW46 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ascl4M0QW46 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ascl4M0QW46 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ascl4M0QW46 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ascl4M0QW46 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ascl4M0QW46 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ascl4M0QW46 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ascl4M0QW46 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ascl4M0QW46 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl4M0QW46 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl4M0QW46 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ascl4M0QW46 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ascl4M0QW46 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms