Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp955bL7N232 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp955bL7N232 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp955bL7N232 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp955bL7N232 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp955bL7N232 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp955bL7N232 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp955bL7N232 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp955bL7N232 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp955bL7N232 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp955bL7N232 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp955bL7N232 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp955bL7N232 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp955bL7N232 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp955bL7N232 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp955bL7N232 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp955bL7N232 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp955bL7N232 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp955bL7N232 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zfp955bL7N232 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zfp955bL7N232 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp955bL7N232 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp955bL7N232 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp955bL7N232 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp955bL7N232 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp955bL7N232 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zfp955bL7N232 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zfp955bL7N232 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp955bL7N232 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp955bL7N232 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zfp955bL7N232 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zfp955bL7N232 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zfp955bL7N232 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp955bL7N232 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zfp955bL7N232 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zfp955bL7N232 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zfp955bL7N232 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zfp955bL7N232 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zfp955bL7N232 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zfp955bL7N232 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zfp955bL7N232 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zfp955bL7N232 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp955bL7N232 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp955bL7N232 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp955bL7N232 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zfp955bL7N232 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms