Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2al1oL7MU04 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2al1oL7MU04 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2al1oL7MU04 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2al1oL7MU04 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2al1oL7MU04 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2al1oL7MU04 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2al1oL7MU04 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2al1oL7MU04 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2al1oL7MU04 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2al1oL7MU04 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2al1oL7MU04 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2al1oL7MU04 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2al1oL7MU04 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2al1oL7MU04 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2al1oL7MU04 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2al1oL7MU04 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2al1oL7MU04 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
H2al1oL7MU04 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2al1oL7MU04 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2al1oL7MU04 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2al1oL7MU04 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2al1oL7MU04 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2al1oL7MU04 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2al1oL7MU04 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2al1oL7MU04 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2al1oL7MU04 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2al1oL7MU04 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2al1oL7MU04 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2al1oL7MU04 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2al1oL7MU04 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2al1oL7MU04 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2al1oL7MU04 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2al1oL7MU04 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2al1oL7MU04 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2al1oL7MU04 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
H2al1oL7MU04 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2al1oL7MU04 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2al1oL7MU04 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2al1oL7MU04 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2al1oL7MU04 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2al1oL7MU04 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2al1oL7MU04 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2al1oL7MU04 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2al1oL7MU04 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2al1oL7MU04 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2al1oL7MU04 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2al1oL7MU04 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2al1oL7MU04 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2al1oL7MU04 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
H2al1oL7MU04 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2al1oL7MU04 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2al1oL7MU04 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2al1oL7MU04 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2al1oL7MU04 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2al1oL7MU04 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2al1oL7MU04 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2al1oL7MU04 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2al1oL7MU04 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2al1oL7MU04 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2al1oL7MU04 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2al1oL7MU04 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2al1oL7MU04 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
H2al1oL7MU04 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2al1oL7MU04 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
H2al1oL7MU04 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2al1oL7MU04 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2al1oL7MU04 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2al1oL7MU04 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2al1oL7MU04 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2al1oL7MU04 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2al1oL7MU04 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2al1oL7MU04 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2al1oL7MU04 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2al1oL7MU04 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2al1oL7MU04 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2al1oL7MU04 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2al1oL7MU04 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms