Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vwa3bJ9JI28 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vwa3bJ9JI28 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vwa3bJ9JI28 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vwa3bJ9JI28 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vwa3bJ9JI28 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Vwa3bJ9JI28 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vwa3bJ9JI28 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vwa3bJ9JI28 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Vwa3bJ9JI28 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Vwa3bJ9JI28 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vwa3bJ9JI28 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Vwa3bJ9JI28 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vwa3bJ9JI28 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vwa3bJ9JI28 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vwa3bJ9JI28 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Vwa3bJ9JI28 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vwa3bJ9JI28 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vwa3bJ9JI28 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vwa3bJ9JI28 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Vwa3bJ9JI28 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Vwa3bJ9JI28 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Vwa3bJ9JI28 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Vwa3bJ9JI28 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Vwa3bJ9JI28 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Vwa3bJ9JI28 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Vwa3bJ9JI28 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Vwa3bJ9JI28 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vwa3bJ9JI28 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Vwa3bJ9JI28 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vwa3bJ9JI28 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vwa3bJ9JI28 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vwa3bJ9JI28 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vwa3bJ9JI28 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Vwa3bJ9JI28 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Vwa3bJ9JI28 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vwa3bJ9JI28 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vwa3bJ9JI28 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vwa3bJ9JI28 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vwa3bJ9JI28 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vwa3bJ9JI28 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vwa3bJ9JI28 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Vwa3bJ9JI28 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Vwa3bJ9JI28 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Vwa3bJ9JI28 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vwa3bJ9JI28 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vwa3bJ9JI28 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vwa3bJ9JI28 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vwa3bJ9JI28 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Vwa3bJ9JI28 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Vwa3bJ9JI28 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Vwa3bJ9JI28 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Vwa3bJ9JI28 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Vwa3bJ9JI28 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Vwa3bJ9JI28 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Vwa3bJ9JI28 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vwa3bJ9JI28 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vwa3bJ9JI28 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vwa3bJ9JI28 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vwa3bJ9JI28 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Vwa3bJ9JI28 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Vwa3bJ9JI28 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Vwa3bJ9JI28 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vwa3bJ9JI28 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vwa3bJ9JI28 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vwa3bJ9JI28 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vwa3bJ9JI28 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Vwa3bJ9JI28 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Vwa3bJ9JI28 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vwa3bJ9JI28 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vwa3bJ9JI28 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Vwa3bJ9JI28 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Vwa3bJ9JI28 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vwa3bJ9JI28 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vwa3bJ9JI28 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vwa3bJ9JI28 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vwa3bJ9JI28 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vwa3bJ9JI28 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Vwa3bJ9JI28 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vwa3bJ9JI28 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Vwa3bJ9JI28 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Vwa3bJ9JI28 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Vwa3bJ9JI28 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Vwa3bJ9JI28 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Vwa3bJ9JI28 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Vwa3bJ9JI28 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Vwa3bJ9JI28 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Vwa3bJ9JI28 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Vwa3bJ9JI28 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Vwa3bJ9JI28 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Vwa3bJ9JI28 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vwa3bJ9JI28 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vwa3bJ9JI28 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vwa3bJ9JI28 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vwa3bJ9JI28 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vwa3bJ9JI28 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Vwa3bJ9JI28 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Vwa3bJ9JI28 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Vwa3bJ9JI28 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Vwa3bJ9JI28 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms