Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21887J3QQ04 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms