Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20877J3QPZ4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20877J3QPZ4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20877J3QPZ4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20877J3QPZ4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20877J3QPZ4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20877J3QPZ4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm20877J3QPZ4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20877J3QPZ4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20877J3QPZ4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20877J3QPZ4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20877J3QPZ4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20877J3QPZ4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20877J3QPZ4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20877J3QPZ4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20877J3QPZ4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20877J3QPZ4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20877J3QPZ4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20877J3QPZ4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20877J3QPZ4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20877J3QPZ4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20877J3QPZ4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20877J3QPZ4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20877J3QPZ4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20877J3QPZ4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20877J3QPZ4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20877J3QPZ4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20877J3QPZ4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20877J3QPZ4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20877J3QPZ4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20877J3QPZ4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20877J3QPZ4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20877J3QPZ4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20877J3QPZ4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20877J3QPZ4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20877J3QPZ4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20877J3QPZ4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20877J3QPZ4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20877J3QPZ4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20877J3QPZ4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20877J3QPZ4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20877J3QPZ4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20877J3QPZ4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20877J3QPZ4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20877J3QPZ4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20877J3QPZ4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20877J3QPZ4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20877J3QPZ4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20877J3QPZ4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20877J3QPZ4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20877J3QPZ4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20877J3QPZ4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20877J3QPZ4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20877J3QPZ4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20877J3QPZ4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20877J3QPZ4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20877J3QPZ4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20877J3QPZ4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20877J3QPZ4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20877J3QPZ4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20877J3QPZ4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20877J3QPZ4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20877J3QPZ4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20877J3QPZ4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20877J3QPZ4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20877J3QPZ4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20877J3QPZ4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20877J3QPZ4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20877J3QPZ4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20877J3QPZ4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20877J3QPZ4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20877J3QPZ4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20877J3QPZ4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20877J3QPZ4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20877J3QPZ4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20877J3QPZ4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20877J3QPZ4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20877J3QPZ4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20877J3QPZ4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20877J3QPZ4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20877J3QPZ4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm20877J3QPZ4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms