Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5849J3QPE5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5849J3QPE5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5849J3QPE5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5849J3QPE5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5849J3QPE5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5849J3QPE5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5849J3QPE5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5849J3QPE5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5849J3QPE5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5849J3QPE5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5849J3QPE5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5849J3QPE5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5849J3QPE5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gm5849J3QPE5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5849J3QPE5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5849J3QPE5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5849J3QPE5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5849J3QPE5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5849J3QPE5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5849J3QPE5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5849J3QPE5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5849J3QPE5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5849J3QPE5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5849J3QPE5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5849J3QPE5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5849J3QPE5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5849J3QPE5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5849J3QPE5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5849J3QPE5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5849J3QPE5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5849J3QPE5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5849J3QPE5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5849J3QPE5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5849J3QPE5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5849J3QPE5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5849J3QPE5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5849J3QPE5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5849J3QPE5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5849J3QPE5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5849J3QPE5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5849J3QPE5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5849J3QPE5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5849J3QPE5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5849J3QPE5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5849J3QPE5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5849J3QPE5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5849J3QPE5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5849J3QPE5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5849J3QPE5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5849J3QPE5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5849J3QPE5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5849J3QPE5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5849J3QPE5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5849J3QPE5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5849J3QPE5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5849J3QPE5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms