Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8356J3QPD3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8356J3QPD3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm8356J3QPD3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm8356J3QPD3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8356J3QPD3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8356J3QPD3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8356J3QPD3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm8356J3QPD3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm8356J3QPD3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8356J3QPD3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8356J3QPD3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8356J3QPD3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8356J3QPD3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8356J3QPD3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8356J3QPD3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8356J3QPD3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8356J3QPD3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8356J3QPD3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8356J3QPD3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8356J3QPD3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm8356J3QPD3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm8356J3QPD3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm8356J3QPD3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm8356J3QPD3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm8356J3QPD3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm8356J3QPD3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm8356J3QPD3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm8356J3QPD3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm8356J3QPD3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm8356J3QPD3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm8356J3QPD3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm8356J3QPD3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm8356J3QPD3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm8356J3QPD3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm8356J3QPD3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm8356J3QPD3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm8356J3QPD3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm8356J3QPD3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm8356J3QPD3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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