Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3099J3QPA5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3099J3QPA5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3099J3QPA5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3099J3QPA5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3099J3QPA5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3099J3QPA5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3099J3QPA5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3099J3QPA5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3099J3QPA5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3099J3QPA5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3099J3QPA5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3099J3QPA5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3099J3QPA5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3099J3QPA5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3099J3QPA5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3099J3QPA5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3099J3QPA5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3099J3QPA5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Gm3099J3QPA5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3099J3QPA5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3099J3QPA5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3099J3QPA5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3099J3QPA5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3099J3QPA5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3099J3QPA5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3099J3QPA5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3099J3QPA5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm3099J3QPA5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3099J3QPA5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3099J3QPA5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3099J3QPA5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3099J3QPA5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3099J3QPA5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3099J3QPA5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3099J3QPA5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3099J3QPA5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3099J3QPA5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3099J3QPA5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3099J3QPA5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3099J3QPA5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3099J3QPA5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3099J3QPA5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3099J3QPA5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3099J3QPA5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3099J3QPA5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms