Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm10428J3QNV7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm10428J3QNV7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10428J3QNV7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10428J3QNV7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10428J3QNV7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm10428J3QNV7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm10428J3QNV7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm10428J3QNV7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm10428J3QNV7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10428J3QNV7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm10428J3QNV7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10428J3QNV7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm10428J3QNV7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm10428J3QNV7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10428J3QNV7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10428J3QNV7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10428J3QNV7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10428J3QNV7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10428J3QNV7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10428J3QNV7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10428J3QNV7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10428J3QNV7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10428J3QNV7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10428J3QNV7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm10428J3QNV7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm10428J3QNV7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm10428J3QNV7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10428J3QNV7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10428J3QNV7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10428J3QNV7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10428J3QNV7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10428J3QNV7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10428J3QNV7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10428J3QNV7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10428J3QNV7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10428J3QNV7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10428J3QNV7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10428J3QNV7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10428J3QNV7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10428J3QNV7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm10428J3QNV7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10428J3QNV7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10428J3QNV7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10428J3QNV7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10428J3QNV7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10428J3QNV7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10428J3QNV7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10428J3QNV7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10428J3QNV7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10428J3QNV7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10428J3QNV7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10428J3QNV7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10428J3QNV7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10428J3QNV7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10428J3QNV7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm10428J3QNV7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm10428J3QNV7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm10428J3QNV7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm10428J3QNV7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm10428J3QNV7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm10428J3QNV7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10428J3QNV7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10428J3QNV7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10428J3QNV7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10428J3QNV7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm10428J3QNV7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm10428J3QNV7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10428J3QNV7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10428J3QNV7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10428J3QNV7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm10428J3QNV7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm10428J3QNV7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm10428J3QNV7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10428J3QNV7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10428J3QNV7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10428J3QNV7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10428J3QNV7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10428J3QNV7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10428J3QNV7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10428J3QNV7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10428J3QNV7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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