Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim18J3QNP2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim18J3QNP2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim18J3QNP2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim18J3QNP2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim18J3QNP2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim18J3QNP2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim18J3QNP2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim18J3QNP2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim18J3QNP2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim18J3QNP2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim18J3QNP2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim18J3QNP2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim18J3QNP2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim18J3QNP2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim18J3QNP2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim18J3QNP2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim18J3QNP2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim18J3QNP2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smim18J3QNP2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim18J3QNP2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smim18J3QNP2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smim18J3QNP2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim18J3QNP2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim18J3QNP2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim18J3QNP2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smim18J3QNP2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smim18J3QNP2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smim18J3QNP2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smim18J3QNP2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smim18J3QNP2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smim18J3QNP2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smim18J3QNP2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smim18J3QNP2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smim18J3QNP2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smim18J3QNP2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smim18J3QNP2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smim18J3QNP2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim18J3QNP2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim18J3QNP2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim18J3QNP2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim18J3QNP2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim18J3QNP2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim18J3QNP2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim18J3QNP2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim18J3QNP2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim18J3QNP2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim18J3QNP2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim18J3QNP2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim18J3QNP2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim18J3QNP2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim18J3QNP2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim18J3QNP2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim18J3QNP2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim18J3QNP2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim18J3QNP2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim18J3QNP2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim18J3QNP2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim18J3QNP2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim18J3QNP2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim18J3QNP2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim18J3QNP2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim18J3QNP2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smim18J3QNP2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Smim18J3QNP2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim18J3QNP2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim18J3QNP2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim18J3QNP2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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