Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20918J3QN17 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20918J3QN17 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20918J3QN17 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20918J3QN17 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20918J3QN17 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20918J3QN17 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm20918J3QN17 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm20918J3QN17 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm20918J3QN17 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm20918J3QN17 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20918J3QN17 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm20918J3QN17 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm20918J3QN17 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm20918J3QN17 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm20918J3QN17 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm20918J3QN17 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm20918J3QN17 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm20918J3QN17 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm20918J3QN17 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm20918J3QN17 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm20918J3QN17 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm20918J3QN17 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20918J3QN17 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20918J3QN17 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20918J3QN17 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20918J3QN17 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20918J3QN17 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20918J3QN17 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20918J3QN17 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20918J3QN17 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20918J3QN17 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20918J3QN17 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20918J3QN17 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20918J3QN17 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20918J3QN17 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20918J3QN17 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20918J3QN17 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20918J3QN17 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20918J3QN17 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm20918J3QN17 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm20918J3QN17 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20918J3QN17 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm20918J3QN17 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20918J3QN17 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20918J3QN17 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20918J3QN17 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20918J3QN17 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20918J3QN17 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20918J3QN17 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20918J3QN17 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20918J3QN17 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20918J3QN17 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20918J3QN17 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20918J3QN17 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20918J3QN17 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20918J3QN17 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20918J3QN17 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20918J3QN17 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20918J3QN17 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20918J3QN17 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20918J3QN17 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20918J3QN17 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms