Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700014D04RikJ3QMS2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700014D04RikJ3QMS2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700014D04RikJ3QMS2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700014D04RikJ3QMS2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700014D04RikJ3QMS2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700014D04RikJ3QMS2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700014D04RikJ3QMS2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700014D04RikJ3QMS2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
1700014D04RikJ3QMS2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700014D04RikJ3QMS2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700014D04RikJ3QMS2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700014D04RikJ3QMS2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700014D04RikJ3QMS2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700014D04RikJ3QMS2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700014D04RikJ3QMS2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700014D04RikJ3QMS2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700014D04RikJ3QMS2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700014D04RikJ3QMS2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700014D04RikJ3QMS2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700014D04RikJ3QMS2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700014D04RikJ3QMS2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700014D04RikJ3QMS2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700014D04RikJ3QMS2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700014D04RikJ3QMS2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700014D04RikJ3QMS2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700014D04RikJ3QMS2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700014D04RikJ3QMS2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700014D04RikJ3QMS2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700014D04RikJ3QMS2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700014D04RikJ3QMS2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
1700014D04RikJ3QMS2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700014D04RikJ3QMS2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700014D04RikJ3QMS2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700014D04RikJ3QMS2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700014D04RikJ3QMS2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700014D04RikJ3QMS2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700014D04RikJ3QMS2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700014D04RikJ3QMS2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700014D04RikJ3QMS2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700014D04RikJ3QMS2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700014D04RikJ3QMS2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700014D04RikJ3QMS2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700014D04RikJ3QMS2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700014D04RikJ3QMS2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700014D04RikJ3QMS2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700014D04RikJ3QMS2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
1700014D04RikJ3QMS2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700014D04RikJ3QMS2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700014D04RikJ3QMS2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700014D04RikJ3QMS2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700014D04RikJ3QMS2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700014D04RikJ3QMS2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700014D04RikJ3QMS2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
1700014D04RikJ3QMS2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700014D04RikJ3QMS2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 245 ms