Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm21969J3QJZ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm21969J3QJZ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm21969J3QJZ1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm21969J3QJZ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm21969J3QJZ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm21969J3QJZ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm21969J3QJZ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm21969J3QJZ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm21969J3QJZ1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm21969J3QJZ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm21969J3QJZ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm21969J3QJZ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm21969J3QJZ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm21969J3QJZ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm21969J3QJZ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm21969J3QJZ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm21969J3QJZ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm21969J3QJZ1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm21969J3QJZ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm21969J3QJZ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm21969J3QJZ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm21969J3QJZ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm21969J3QJZ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm21969J3QJZ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm21969J3QJZ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm21969J3QJZ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm21969J3QJZ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm21969J3QJZ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm21969J3QJZ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm21969J3QJZ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm21969J3QJZ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm21969J3QJZ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm21969J3QJZ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm21969J3QJZ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm21969J3QJZ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm21969J3QJZ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm21969J3QJZ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm21969J3QJZ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm21969J3QJZ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm21969J3QJZ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm21969J3QJZ1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm21969J3QJZ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm21969J3QJZ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm21969J3QJZ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gm21969J3QJZ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm21969J3QJZ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm21969J3QJZ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm21969J3QJZ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gm21969J3QJZ1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gm21969J3QJZ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm21969J3QJZ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm21969J3QJZ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm21969J3QJZ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm21969J3QJZ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gm21969J3QJZ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Gm21969J3QJZ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gm21969J3QJZ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Gm21969J3QJZ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gm21969J3QJZ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm21969J3QJZ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm21969J3QJZ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm21969J3QJZ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm21969J3QJZ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm21969J3QJZ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gm21969J3QJZ1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gm21969J3QJZ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gm21969J3QJZ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gm21969J3QJZ1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm21969J3QJZ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm21969J3QJZ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm21969J3QJZ1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm21969J3QJZ1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm21969J3QJZ1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm21969J3QJZ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm21969J3QJZ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm21969J3QJZ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm21969J3QJZ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm21969J3QJZ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm21969J3QJZ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm21969J3QJZ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm21969J3QJZ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm21969J3QJZ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm21969J3QJZ1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm21969J3QJZ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm21969J3QJZ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm21969J3QJZ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm21969J3QJZ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm21969J3QJZ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm21969J3QJZ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm21969J3QJZ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm21969J3QJZ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm21969J3QJZ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm21969J3QJZ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm21969J3QJZ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm21969J3QJZ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gm21969J3QJZ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm21969J3QJZ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm21969J3QJZ1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm21969J3QJZ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms