Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
7530416G11RikJ3QJX6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
7530416G11RikJ3QJX6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms