Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pot1bH7BX60 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pot1bH7BX60 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pot1bH7BX60 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pot1bH7BX60 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pot1bH7BX60 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pot1bH7BX60 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pot1bH7BX60 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pot1bH7BX60 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pot1bH7BX60 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pot1bH7BX60 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pot1bH7BX60 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pot1bH7BX60 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pot1bH7BX60 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pot1bH7BX60 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pot1bH7BX60 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pot1bH7BX60 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pot1bH7BX60 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pot1bH7BX60 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pot1bH7BX60 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pot1bH7BX60 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pot1bH7BX60 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pot1bH7BX60 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pot1bH7BX60 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pot1bH7BX60 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pot1bH7BX60 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pot1bH7BX60 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pot1bH7BX60 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pot1bH7BX60 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pot1bH7BX60 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pot1bH7BX60 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pot1bH7BX60 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pot1bH7BX60 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pot1bH7BX60 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pot1bH7BX60 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pot1bH7BX60 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pot1bH7BX60 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pot1bH7BX60 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pot1bH7BX60 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pot1bH7BX60 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pot1bH7BX60 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pot1bH7BX60 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pot1bH7BX60 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pot1bH7BX60 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pot1bH7BX60 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pot1bH7BX60 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pot1bH7BX60 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pot1bH7BX60 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pot1bH7BX60 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pot1bH7BX60 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pot1bH7BX60 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pot1bH7BX60 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pot1bH7BX60 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pot1bH7BX60 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pot1bH7BX60 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pot1bH7BX60 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pot1bH7BX60 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pot1bH7BX60 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pot1bH7BX60 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pot1bH7BX60 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pot1bH7BX60 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pot1bH7BX60 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pot1bH7BX60 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pot1bH7BX60 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pot1bH7BX60 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pot1bH7BX60 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pot1bH7BX60 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pot1bH7BX60 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pot1bH7BX60 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pot1bH7BX60 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pot1bH7BX60 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pot1bH7BX60 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pot1bH7BX60 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pot1bH7BX60 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pot1bH7BX60 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pot1bH7BX60 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pot1bH7BX60 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pot1bH7BX60 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pot1bH7BX60 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pot1bH7BX60 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pot1bH7BX60 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pot1bH7BX60 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pot1bH7BX60 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pot1bH7BX60 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms