Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn34aG3UW52 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn34aG3UW52 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn34aG3UW52 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn34aG3UW52 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn34aG3UW52 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn34aG3UW52 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn34aG3UW52 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn34aG3UW52 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn34aG3UW52 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn34aG3UW52 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn34aG3UW52 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn34aG3UW52 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn34aG3UW52 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn34aG3UW52 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn34aG3UW52 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn34aG3UW52 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn34aG3UW52 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn34aG3UW52 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn34aG3UW52 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn34aG3UW52 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn34aG3UW52 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn34aG3UW52 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn34aG3UW52 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn34aG3UW52 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn34aG3UW52 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn34aG3UW52 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn34aG3UW52 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn34aG3UW52 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn34aG3UW52 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn34aG3UW52 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn34aG3UW52 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn34aG3UW52 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn34aG3UW52 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn34aG3UW52 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn34aG3UW52 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn34aG3UW52 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn34aG3UW52 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn34aG3UW52 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn34aG3UW52 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn34aG3UW52 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn34aG3UW52 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn34aG3UW52 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn34aG3UW52 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn34aG3UW52 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn34aG3UW52 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn34aG3UW52 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn34aG3UW52 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn34aG3UW52 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn34aG3UW52 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn34aG3UW52 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cldn34aG3UW52 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn34aG3UW52 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn34aG3UW52 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn34aG3UW52 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn34aG3UW52 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn34aG3UW52 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn34aG3UW52 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn34aG3UW52 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn34aG3UW52 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn34aG3UW52 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn34aG3UW52 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn34aG3UW52 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn34aG3UW52 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn34aG3UW52 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn34aG3UW52 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn34aG3UW52 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn34aG3UW52 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn34aG3UW52 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cldn34aG3UW52 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cldn34aG3UW52 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cldn34aG3UW52 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn34aG3UW52 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn34aG3UW52 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn34aG3UW52 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn34aG3UW52 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms