Protein–RNA interactions for Protein: G3UVW3

Slc38a6, Probable sodium-coupled neutral amino acid transporter 6, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a6G3UVW3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc38a6G3UVW3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc38a6G3UVW3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc38a6G3UVW3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc38a6G3UVW3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc38a6G3UVW3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc38a6G3UVW3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc38a6G3UVW3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc38a6G3UVW3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc38a6G3UVW3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc38a6G3UVW3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc38a6G3UVW3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc38a6G3UVW3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc38a6G3UVW3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc38a6G3UVW3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc38a6G3UVW3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc38a6G3UVW3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc38a6G3UVW3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc38a6G3UVW3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc38a6G3UVW3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc38a6G3UVW3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc38a6G3UVW3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc38a6G3UVW3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc38a6G3UVW3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc38a6G3UVW3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a6G3UVW3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a6G3UVW3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a6G3UVW3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a6G3UVW3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a6G3UVW3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a6G3UVW3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a6G3UVW3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a6G3UVW3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a6G3UVW3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a6G3UVW3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a6G3UVW3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc38a6G3UVW3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc38a6G3UVW3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc38a6G3UVW3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc38a6G3UVW3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc38a6G3UVW3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc38a6G3UVW3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc38a6G3UVW3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc38a6G3UVW3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc38a6G3UVW3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc38a6G3UVW3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc38a6G3UVW3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc38a6G3UVW3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc38a6G3UVW3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc38a6G3UVW3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc38a6G3UVW3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc38a6G3UVW3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc38a6G3UVW3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc38a6G3UVW3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms