Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp9yF8VPU6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp9yF8VPU6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp9yF8VPU6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp9yF8VPU6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp9yF8VPU6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp9yF8VPU6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp9yF8VPU6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp9yF8VPU6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp9yF8VPU6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp9yF8VPU6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp9yF8VPU6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp9yF8VPU6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp9yF8VPU6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp9yF8VPU6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp9yF8VPU6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp9yF8VPU6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp9yF8VPU6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp9yF8VPU6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp9yF8VPU6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp9yF8VPU6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp9yF8VPU6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp9yF8VPU6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp9yF8VPU6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp9yF8VPU6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp9yF8VPU6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp9yF8VPU6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp9yF8VPU6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp9yF8VPU6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp9yF8VPU6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp9yF8VPU6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp9yF8VPU6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp9yF8VPU6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp9yF8VPU6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp9yF8VPU6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp9yF8VPU6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp9yF8VPU6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp9yF8VPU6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp9yF8VPU6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp9yF8VPU6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp9yF8VPU6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp9yF8VPU6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp9yF8VPU6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp9yF8VPU6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp9yF8VPU6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp9yF8VPU6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp9yF8VPU6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp9yF8VPU6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp9yF8VPU6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp9yF8VPU6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp9yF8VPU6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp9yF8VPU6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp9yF8VPU6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp9yF8VPU6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp9yF8VPU6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp9yF8VPU6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp9yF8VPU6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp9yF8VPU6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp9yF8VPU6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp9yF8VPU6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp9yF8VPU6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp9yF8VPU6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms