Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm17555F6U8B9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm17555F6U8B9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm17555F6U8B9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm17555F6U8B9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm17555F6U8B9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm17555F6U8B9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm17555F6U8B9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm17555F6U8B9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm17555F6U8B9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm17555F6U8B9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm17555F6U8B9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm17555F6U8B9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm17555F6U8B9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17555F6U8B9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17555F6U8B9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17555F6U8B9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm17555F6U8B9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm17555F6U8B9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm17555F6U8B9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm17555F6U8B9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm17555F6U8B9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm17555F6U8B9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm17555F6U8B9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm17555F6U8B9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm17555F6U8B9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm17555F6U8B9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm17555F6U8B9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm17555F6U8B9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm17555F6U8B9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm17555F6U8B9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm17555F6U8B9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm17555F6U8B9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm17555F6U8B9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm17555F6U8B9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm17555F6U8B9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm17555F6U8B9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm17555F6U8B9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm17555F6U8B9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms