Protein–RNA interactions for Protein: F6R3J9

Gm8879, Predicted gene 8879, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8879F6R3J9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm8879F6R3J9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm8879F6R3J9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8879F6R3J9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8879F6R3J9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8879F6R3J9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8879F6R3J9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm8879F6R3J9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm8879F6R3J9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm8879F6R3J9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm8879F6R3J9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm8879F6R3J9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm8879F6R3J9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8879F6R3J9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8879F6R3J9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8879F6R3J9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8879F6R3J9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8879F6R3J9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8879F6R3J9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8879F6R3J9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8879F6R3J9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8879F6R3J9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8879F6R3J9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8879F6R3J9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8879F6R3J9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8879F6R3J9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8879F6R3J9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8879F6R3J9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8879F6R3J9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8879F6R3J9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8879F6R3J9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8879F6R3J9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm8879F6R3J9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8879F6R3J9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8879F6R3J9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8879F6R3J9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8879F6R3J9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8879F6R3J9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8879F6R3J9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8879F6R3J9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8879F6R3J9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8879F6R3J9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8879F6R3J9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8879F6R3J9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8879F6R3J9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8879F6R3J9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8879F6R3J9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8879F6R3J9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8879F6R3J9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8879F6R3J9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8879F6R3J9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8879F6R3J9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8879F6R3J9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8879F6R3J9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8879F6R3J9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8879F6R3J9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8879F6R3J9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm8879F6R3J9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm8879F6R3J9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm8879F6R3J9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8879F6R3J9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8879F6R3J9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8879F6R3J9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8879F6R3J9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8879F6R3J9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8879F6R3J9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm8879F6R3J9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm8879F6R3J9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8879F6R3J9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8879F6R3J9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8879F6R3J9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8879F6R3J9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8879F6R3J9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8879F6R3J9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8879F6R3J9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8879F6R3J9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8879F6R3J9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8879F6R3J9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8879F6R3J9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8879F6R3J9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8879F6R3J9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8879F6R3J9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8879F6R3J9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms