Protein–RNA interactions for Protein: F2YMG0

Prss56, Serine protease 56, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss56F2YMG0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prss56F2YMG0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prss56F2YMG0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prss56F2YMG0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prss56F2YMG0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss56F2YMG0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss56F2YMG0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss56F2YMG0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss56F2YMG0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss56F2YMG0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prss56F2YMG0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prss56F2YMG0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss56F2YMG0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prss56F2YMG0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prss56F2YMG0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prss56F2YMG0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prss56F2YMG0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prss56F2YMG0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prss56F2YMG0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prss56F2YMG0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prss56F2YMG0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prss56F2YMG0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prss56F2YMG0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prss56F2YMG0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prss56F2YMG0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prss56F2YMG0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prss56F2YMG0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prss56F2YMG0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prss56F2YMG0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prss56F2YMG0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss56F2YMG0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss56F2YMG0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss56F2YMG0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss56F2YMG0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prss56F2YMG0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss56F2YMG0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss56F2YMG0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss56F2YMG0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss56F2YMG0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prss56F2YMG0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prss56F2YMG0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prss56F2YMG0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss56F2YMG0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prss56F2YMG0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prss56F2YMG0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prss56F2YMG0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prss56F2YMG0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prss56F2YMG0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prss56F2YMG0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prss56F2YMG0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prss56F2YMG0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prss56F2YMG0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prss56F2YMG0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prss56F2YMG0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prss56F2YMG0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prss56F2YMG0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prss56F2YMG0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prss56F2YMG0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prss56F2YMG0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prss56F2YMG0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prss56F2YMG0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prss56F2YMG0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prss56F2YMG0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prss56F2YMG0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Prss56F2YMG0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prss56F2YMG0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms