Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc7bE9Q9Y3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc7bE9Q9Y3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc7bE9Q9Y3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc7bE9Q9Y3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7bE9Q9Y3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms