Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm2237E9Q501 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm2237E9Q501 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm2237E9Q501 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm2237E9Q501 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm2237E9Q501 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm2237E9Q501 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm2237E9Q501 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm2237E9Q501 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm2237E9Q501 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm2237E9Q501 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm2237E9Q501 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm2237E9Q501 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm2237E9Q501 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm2237E9Q501 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm2237E9Q501 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm2237E9Q501 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm2237E9Q501 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm2237E9Q501 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm2237E9Q501 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm2237E9Q501 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm2237E9Q501 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm2237E9Q501 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm2237E9Q501 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm2237E9Q501 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm2237E9Q501 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm2237E9Q501 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm2237E9Q501 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm2237E9Q501 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm2237E9Q501 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm2237E9Q501 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm2237E9Q501 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm2237E9Q501 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm2237E9Q501 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm2237E9Q501 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm2237E9Q501 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm2237E9Q501 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm2237E9Q501 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm2237E9Q501 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm2237E9Q501 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm2237E9Q501 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm2237E9Q501 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm2237E9Q501 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm2237E9Q501 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm2237E9Q501 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm2237E9Q501 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm2237E9Q501 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm2237E9Q501 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm2237E9Q501 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm2237E9Q501 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm2237E9Q501 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm2237E9Q501 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm2237E9Q501 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm2237E9Q501 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm2237E9Q501 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm2237E9Q501 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm2237E9Q501 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm2237E9Q501 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm2237E9Q501 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm2237E9Q501 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm2237E9Q501 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm2237E9Q501 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm2237E9Q501 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm2237E9Q501 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm2237E9Q501 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm2237E9Q501 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm2237E9Q501 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm2237E9Q501 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm2237E9Q501 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm2237E9Q501 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm2237E9Q501 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm2237E9Q501 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm2237E9Q501 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm2237E9Q501 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm2237E9Q501 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm2237E9Q501 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm2237E9Q501 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms