Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1L0

Vmn2r80, Vomeronasal 2, receptor 80, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r80E9Q1L0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn2r80E9Q1L0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn2r80E9Q1L0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn2r80E9Q1L0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn2r80E9Q1L0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn2r80E9Q1L0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn2r80E9Q1L0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn2r80E9Q1L0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn2r80E9Q1L0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn2r80E9Q1L0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn2r80E9Q1L0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn2r80E9Q1L0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn2r80E9Q1L0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn2r80E9Q1L0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn2r80E9Q1L0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn2r80E9Q1L0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn2r80E9Q1L0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn2r80E9Q1L0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn2r80E9Q1L0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn2r80E9Q1L0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn2r80E9Q1L0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn2r80E9Q1L0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn2r80E9Q1L0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn2r80E9Q1L0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn2r80E9Q1L0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn2r80E9Q1L0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn2r80E9Q1L0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn2r80E9Q1L0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vmn2r80E9Q1L0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn2r80E9Q1L0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn2r80E9Q1L0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r80E9Q1L0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r80E9Q1L0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r80E9Q1L0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r80E9Q1L0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r80E9Q1L0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r80E9Q1L0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r80E9Q1L0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn2r80E9Q1L0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn2r80E9Q1L0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn2r80E9Q1L0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn2r80E9Q1L0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn2r80E9Q1L0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn2r80E9Q1L0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn2r80E9Q1L0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vmn2r80E9Q1L0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn2r80E9Q1L0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn2r80E9Q1L0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms