Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r68E9Q0V3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r68E9Q0V3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r68E9Q0V3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r68E9Q0V3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r68E9Q0V3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r68E9Q0V3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r68E9Q0V3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r68E9Q0V3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r68E9Q0V3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r68E9Q0V3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r68E9Q0V3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r68E9Q0V3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r68E9Q0V3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r68E9Q0V3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r68E9Q0V3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r68E9Q0V3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r68E9Q0V3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r68E9Q0V3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r68E9Q0V3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r68E9Q0V3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r68E9Q0V3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r68E9Q0V3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r68E9Q0V3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r68E9Q0V3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r68E9Q0V3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r68E9Q0V3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r68E9Q0V3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r68E9Q0V3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r68E9Q0V3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r68E9Q0V3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r68E9Q0V3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r68E9Q0V3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r68E9Q0V3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r68E9Q0V3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r68E9Q0V3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r68E9Q0V3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r68E9Q0V3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r68E9Q0V3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r68E9Q0V3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r68E9Q0V3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r68E9Q0V3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r68E9Q0V3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r68E9Q0V3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r68E9Q0V3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r68E9Q0V3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r68E9Q0V3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r68E9Q0V3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r68E9Q0V3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r68E9Q0V3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r68E9Q0V3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r68E9Q0V3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r68E9Q0V3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r68E9Q0V3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r68E9Q0V3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r68E9Q0V3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r68E9Q0V3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r68E9Q0V3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r68E9Q0V3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r68E9Q0V3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r68E9Q0V3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r68E9Q0V3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r68E9Q0V3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r68E9Q0V3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r68E9Q0V3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r68E9Q0V3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r68E9Q0V3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r68E9Q0V3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r68E9Q0V3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r68E9Q0V3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r68E9Q0V3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r68E9Q0V3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r68E9Q0V3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms