Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc62E9PVD1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc62E9PVD1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc62E9PVD1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc62E9PVD1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc62E9PVD1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc62E9PVD1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc62E9PVD1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc62E9PVD1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc62E9PVD1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc62E9PVD1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc62E9PVD1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc62E9PVD1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc62E9PVD1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc62E9PVD1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc62E9PVD1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc62E9PVD1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc62E9PVD1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc62E9PVD1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc62E9PVD1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc62E9PVD1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc62E9PVD1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc62E9PVD1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc62E9PVD1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc62E9PVD1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc62E9PVD1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc62E9PVD1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc62E9PVD1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc62E9PVD1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc62E9PVD1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc62E9PVD1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc62E9PVD1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc62E9PVD1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc62E9PVD1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc62E9PVD1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc62E9PVD1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc62E9PVD1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc62E9PVD1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc62E9PVD1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc62E9PVD1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc62E9PVD1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc62E9PVD1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc62E9PVD1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc62E9PVD1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc62E9PVD1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc62E9PVD1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc62E9PVD1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc62E9PVD1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc62E9PVD1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc62E9PVD1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc62E9PVD1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc62E9PVD1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc62E9PVD1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc62E9PVD1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc62E9PVD1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc62E9PVD1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc62E9PVD1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc62E9PVD1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc62E9PVD1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc62E9PVD1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc62E9PVD1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc62E9PVD1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc62E9PVD1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc62E9PVD1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc62E9PVD1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc62E9PVD1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc62E9PVD1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc62E9PVD1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc62E9PVD1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc62E9PVD1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc62E9PVD1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc62E9PVD1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc62E9PVD1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc62E9PVD1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc62E9PVD1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc62E9PVD1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc62E9PVD1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc62E9PVD1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc62E9PVD1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc62E9PVD1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms