Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl3E0CZ16 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl3E0CZ16 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl3E0CZ16 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl3E0CZ16 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl3E0CZ16 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl3E0CZ16 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl3E0CZ16 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl3E0CZ16 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl3E0CZ16 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl3E0CZ16 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl3E0CZ16 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl3E0CZ16 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl3E0CZ16 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Klhl3E0CZ16 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Klhl3E0CZ16 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl3E0CZ16 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl3E0CZ16 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl3E0CZ16 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl3E0CZ16 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl3E0CZ16 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl3E0CZ16 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl3E0CZ16 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhl3E0CZ16 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhl3E0CZ16 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhl3E0CZ16 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhl3E0CZ16 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Klhl3E0CZ16 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Klhl3E0CZ16 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Klhl3E0CZ16 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klhl3E0CZ16 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhl3E0CZ16 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhl3E0CZ16 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhl3E0CZ16 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhl3E0CZ16 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhl3E0CZ16 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl3E0CZ16 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl3E0CZ16 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhl3E0CZ16 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhl3E0CZ16 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl3E0CZ16 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhl3E0CZ16 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhl3E0CZ16 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhl3E0CZ16 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl3E0CZ16 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl3E0CZ16 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klhl3E0CZ16 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhl3E0CZ16 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhl3E0CZ16 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl3E0CZ16 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl3E0CZ16 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl3E0CZ16 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl3E0CZ16 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl3E0CZ16 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl3E0CZ16 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl3E0CZ16 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhl3E0CZ16 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhl3E0CZ16 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl3E0CZ16 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl3E0CZ16 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl3E0CZ16 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl3E0CZ16 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl3E0CZ16 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl3E0CZ16 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl3E0CZ16 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl3E0CZ16 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl3E0CZ16 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl3E0CZ16 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl3E0CZ16 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl3E0CZ16 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl3E0CZ16 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl3E0CZ16 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Klhl3E0CZ16 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl3E0CZ16 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl3E0CZ16 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl3E0CZ16 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl3E0CZ16 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl3E0CZ16 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl3E0CZ16 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl3E0CZ16 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl3E0CZ16 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl3E0CZ16 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms