Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC035044E0CXF8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC035044E0CXF8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC035044E0CXF8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC035044E0CXF8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC035044E0CXF8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC035044E0CXF8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC035044E0CXF8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC035044E0CXF8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC035044E0CXF8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC035044E0CXF8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC035044E0CXF8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BC035044E0CXF8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BC035044E0CXF8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC035044E0CXF8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BC035044E0CXF8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC035044E0CXF8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC035044E0CXF8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BC035044E0CXF8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BC035044E0CXF8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BC035044E0CXF8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BC035044E0CXF8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BC035044E0CXF8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BC035044E0CXF8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BC035044E0CXF8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BC035044E0CXF8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BC035044E0CXF8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BC035044E0CXF8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BC035044E0CXF8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BC035044E0CXF8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BC035044E0CXF8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BC035044E0CXF8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BC035044E0CXF8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BC035044E0CXF8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BC035044E0CXF8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BC035044E0CXF8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BC035044E0CXF8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BC035044E0CXF8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BC035044E0CXF8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BC035044E0CXF8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BC035044E0CXF8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BC035044E0CXF8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BC035044E0CXF8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC035044E0CXF8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC035044E0CXF8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC035044E0CXF8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC035044E0CXF8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BC035044E0CXF8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BC035044E0CXF8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BC035044E0CXF8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BC035044E0CXF8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC035044E0CXF8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BC035044E0CXF8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC035044E0CXF8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC035044E0CXF8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC035044E0CXF8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC035044E0CXF8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC035044E0CXF8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC035044E0CXF8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BC035044E0CXF8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BC035044E0CXF8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BC035044E0CXF8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BC035044E0CXF8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BC035044E0CXF8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC035044E0CXF8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC035044E0CXF8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BC035044E0CXF8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC035044E0CXF8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC035044E0CXF8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC035044E0CXF8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC035044E0CXF8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BC035044E0CXF8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BC035044E0CXF8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BC035044E0CXF8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BC035044E0CXF8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BC035044E0CXF8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BC035044E0CXF8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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BC035044E0CXF8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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