Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5478D3Z6R0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5478D3Z6R0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5478D3Z6R0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5478D3Z6R0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5478D3Z6R0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5478D3Z6R0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5478D3Z6R0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5478D3Z6R0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5478D3Z6R0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5478D3Z6R0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5478D3Z6R0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5478D3Z6R0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5478D3Z6R0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5478D3Z6R0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5478D3Z6R0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5478D3Z6R0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5478D3Z6R0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5478D3Z6R0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5478D3Z6R0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5478D3Z6R0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5478D3Z6R0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5478D3Z6R0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5478D3Z6R0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5478D3Z6R0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5478D3Z6R0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5478D3Z6R0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5478D3Z6R0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5478D3Z6R0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5478D3Z6R0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5478D3Z6R0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5478D3Z6R0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5478D3Z6R0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5478D3Z6R0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5478D3Z6R0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5478D3Z6R0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5478D3Z6R0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5478D3Z6R0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5478D3Z6R0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5478D3Z6R0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5478D3Z6R0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5478D3Z6R0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5478D3Z6R0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5478D3Z6R0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5478D3Z6R0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5478D3Z6R0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5478D3Z6R0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5478D3Z6R0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5478D3Z6R0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5478D3Z6R0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5478D3Z6R0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm5478D3Z6R0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5478D3Z6R0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5478D3Z6R0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5478D3Z6R0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5478D3Z6R0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5478D3Z6R0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5478D3Z6R0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5478D3Z6R0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5478D3Z6R0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5478D3Z6R0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5478D3Z6R0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5478D3Z6R0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5478D3Z6R0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5478D3Z6R0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5478D3Z6R0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5478D3Z6R0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5478D3Z6R0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5478D3Z6R0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5478D3Z6R0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5478D3Z6R0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5478D3Z6R0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5478D3Z6R0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5478D3Z6R0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5478D3Z6R0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5478D3Z6R0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5478D3Z6R0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5478D3Z6R0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5478D3Z6R0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5478D3Z6R0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5478D3Z6R0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5478D3Z6R0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms