Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms