Protein–RNA interactions for Protein: D3Z291

Calhm1, Calcium homeostasis modulator protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm1D3Z291 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calhm1D3Z291 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calhm1D3Z291 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calhm1D3Z291 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calhm1D3Z291 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calhm1D3Z291 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calhm1D3Z291 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calhm1D3Z291 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calhm1D3Z291 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calhm1D3Z291 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calhm1D3Z291 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calhm1D3Z291 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calhm1D3Z291 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calhm1D3Z291 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calhm1D3Z291 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calhm1D3Z291 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calhm1D3Z291 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calhm1D3Z291 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calhm1D3Z291 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calhm1D3Z291 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calhm1D3Z291 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calhm1D3Z291 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calhm1D3Z291 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calhm1D3Z291 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calhm1D3Z291 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calhm1D3Z291 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Calhm1D3Z291 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calhm1D3Z291 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calhm1D3Z291 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calhm1D3Z291 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calhm1D3Z291 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calhm1D3Z291 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calhm1D3Z291 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Calhm1D3Z291 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calhm1D3Z291 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calhm1D3Z291 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calhm1D3Z291 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calhm1D3Z291 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calhm1D3Z291 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Calhm1D3Z291 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calhm1D3Z291 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Calhm1D3Z291 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Calhm1D3Z291 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calhm1D3Z291 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calhm1D3Z291 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calhm1D3Z291 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calhm1D3Z291 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calhm1D3Z291 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calhm1D3Z291 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calhm1D3Z291 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Calhm1D3Z291 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calhm1D3Z291 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calhm1D3Z291 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calhm1D3Z291 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calhm1D3Z291 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calhm1D3Z291 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calhm1D3Z291 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calhm1D3Z291 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calhm1D3Z291 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calhm1D3Z291 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calhm1D3Z291 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calhm1D3Z291 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calhm1D3Z291 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms