Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
1700015F17RikD3YUK8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700015F17RikD3YUK8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700015F17RikD3YUK8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
1700015F17RikD3YUK8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
1700015F17RikD3YUK8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700015F17RikD3YUK8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700015F17RikD3YUK8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
1700015F17RikD3YUK8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
1700015F17RikD3YUK8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
1700015F17RikD3YUK8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700015F17RikD3YUK8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700015F17RikD3YUK8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700015F17RikD3YUK8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700015F17RikD3YUK8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
1700015F17RikD3YUK8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
1700015F17RikD3YUK8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700015F17RikD3YUK8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700015F17RikD3YUK8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700015F17RikD3YUK8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700015F17RikD3YUK8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
1700015F17RikD3YUK8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700015F17RikD3YUK8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700015F17RikD3YUK8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700015F17RikD3YUK8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700015F17RikD3YUK8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700015F17RikD3YUK8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700015F17RikD3YUK8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700015F17RikD3YUK8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700015F17RikD3YUK8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700015F17RikD3YUK8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700015F17RikD3YUK8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
1700015F17RikD3YUK8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms