Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d4D3YUH6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d4D3YUH6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2d4D3YUH6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d4D3YUH6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms