Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rd3lB2RV38 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rd3lB2RV38 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rd3lB2RV38 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rd3lB2RV38 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rd3lB2RV38 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Rd3lB2RV38 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rd3lB2RV38 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rd3lB2RV38 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rd3lB2RV38 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rd3lB2RV38 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rd3lB2RV38 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rd3lB2RV38 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rd3lB2RV38 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rd3lB2RV38 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rd3lB2RV38 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rd3lB2RV38 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rd3lB2RV38 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rd3lB2RV38 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rd3lB2RV38 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rd3lB2RV38 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rd3lB2RV38 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rd3lB2RV38 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rd3lB2RV38 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rd3lB2RV38 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rd3lB2RV38 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rd3lB2RV38 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rd3lB2RV38 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rd3lB2RV38 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rd3lB2RV38 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rd3lB2RV38 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rd3lB2RV38 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rd3lB2RV38 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rd3lB2RV38 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1604.9 ms