Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud4B2RRE7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud4B2RRE7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud4B2RRE7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud4B2RRE7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud4B2RRE7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud4B2RRE7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud4B2RRE7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud4B2RRE7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud4B2RRE7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud4B2RRE7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otud4B2RRE7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud4B2RRE7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud4B2RRE7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud4B2RRE7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Otud4B2RRE7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Otud4B2RRE7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Otud4B2RRE7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otud4B2RRE7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud4B2RRE7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud4B2RRE7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud4B2RRE7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud4B2RRE7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud4B2RRE7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud4B2RRE7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud4B2RRE7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud4B2RRE7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Otud4B2RRE7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud4B2RRE7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud4B2RRE7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud4B2RRE7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud4B2RRE7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud4B2RRE7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud4B2RRE7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud4B2RRE7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud4B2RRE7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud4B2RRE7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otud4B2RRE7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otud4B2RRE7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otud4B2RRE7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Otud4B2RRE7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otud4B2RRE7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otud4B2RRE7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otud4B2RRE7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otud4B2RRE7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Otud4B2RRE7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Otud4B2RRE7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Otud4B2RRE7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Otud4B2RRE7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otud4B2RRE7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otud4B2RRE7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Otud4B2RRE7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otud4B2RRE7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Otud4B2RRE7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Otud4B2RRE7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud4B2RRE7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud4B2RRE7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud4B2RRE7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud4B2RRE7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud4B2RRE7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud4B2RRE7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud4B2RRE7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud4B2RRE7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud4B2RRE7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud4B2RRE7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms