Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brpf3B2KF05 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Brpf3B2KF05 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brpf3B2KF05 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brpf3B2KF05 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brpf3B2KF05 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Brpf3B2KF05 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brpf3B2KF05 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brpf3B2KF05 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brpf3B2KF05 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Brpf3B2KF05 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Brpf3B2KF05 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brpf3B2KF05 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brpf3B2KF05 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brpf3B2KF05 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Brpf3B2KF05 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brpf3B2KF05 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brpf3B2KF05 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Brpf3B2KF05 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brpf3B2KF05 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brpf3B2KF05 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brpf3B2KF05 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brpf3B2KF05 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Brpf3B2KF05 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Brpf3B2KF05 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Brpf3B2KF05 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Brpf3B2KF05 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Brpf3B2KF05 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brpf3B2KF05 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brpf3B2KF05 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brpf3B2KF05 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Brpf3B2KF05 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Brpf3B2KF05 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brpf3B2KF05 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brpf3B2KF05 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brpf3B2KF05 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brpf3B2KF05 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brpf3B2KF05 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brpf3B2KF05 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brpf3B2KF05 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brpf3B2KF05 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brpf3B2KF05 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brpf3B2KF05 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Brpf3B2KF05 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Brpf3B2KF05 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Brpf3B2KF05 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Brpf3B2KF05 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Brpf3B2KF05 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brpf3B2KF05 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brpf3B2KF05 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brpf3B2KF05 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Brpf3B2KF05 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brpf3B2KF05 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brpf3B2KF05 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brpf3B2KF05 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brpf3B2KF05 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brpf3B2KF05 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Brpf3B2KF05 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Brpf3B2KF05 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Brpf3B2KF05 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brpf3B2KF05 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Brpf3B2KF05 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brpf3B2KF05 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brpf3B2KF05 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brpf3B2KF05 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Brpf3B2KF05 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Brpf3B2KF05 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Brpf3B2KF05 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Brpf3B2KF05 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Brpf3B2KF05 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Brpf3B2KF05 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Brpf3B2KF05 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Brpf3B2KF05 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Brpf3B2KF05 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Brpf3B2KF05 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Brpf3B2KF05 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brpf3B2KF05 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brpf3B2KF05 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brpf3B2KF05 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brpf3B2KF05 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brpf3B2KF05 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Brpf3B2KF05 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brpf3B2KF05 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brpf3B2KF05 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brpf3B2KF05 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brpf3B2KF05 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brpf3B2KF05 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brpf3B2KF05 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brpf3B2KF05 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brpf3B2KF05 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brpf3B2KF05 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brpf3B2KF05 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brpf3B2KF05 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Brpf3B2KF05 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brpf3B2KF05 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brpf3B2KF05 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brpf3B2KF05 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brpf3B2KF05 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brpf3B2KF05 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brpf3B2KF05 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms