Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23■■□□□ 1.27
H60cB1B213 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H60cB1B213 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H60cB1B213 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H60cB1B213 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H60cB1B213 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H60cB1B213 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H60cB1B213 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H60cB1B213 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H60cB1B213 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H60cB1B213 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H60cB1B213 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H60cB1B213 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H60cB1B213 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H60cB1B213 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
H60cB1B213 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H60cB1B213 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H60cB1B213 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H60cB1B213 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
H60cB1B213 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H60cB1B213 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H60cB1B213 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H60cB1B213 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H60cB1B213 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H60cB1B213 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H60cB1B213 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H60cB1B213 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H60cB1B213 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
H60cB1B213 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H60cB1B213 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H60cB1B213 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H60cB1B213 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H60cB1B213 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H60cB1B213 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H60cB1B213 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H60cB1B213 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H60cB1B213 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H60cB1B213 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H60cB1B213 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H60cB1B213 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H60cB1B213 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H60cB1B213 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H60cB1B213 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H60cB1B213 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H60cB1B213 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H60cB1B213 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H60cB1B213 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H60cB1B213 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H60cB1B213 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H60cB1B213 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H60cB1B213 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H60cB1B213 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H60cB1B213 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H60cB1B213 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H60cB1B213 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H60cB1B213 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H60cB1B213 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H60cB1B213 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H60cB1B213 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H60cB1B213 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H60cB1B213 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H60cB1B213 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
H60cB1B213 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H60cB1B213 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H60cB1B213 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H60cB1B213 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H60cB1B213 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H60cB1B213 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H60cB1B213 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H60cB1B213 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H60cB1B213 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H60cB1B213 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H60cB1B213 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H60cB1B213 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H60cB1B213 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H60cB1B213 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H60cB1B213 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H60cB1B213 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H60cB1B213 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H60cB1B213 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H60cB1B213 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H60cB1B213 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H60cB1B213 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H60cB1B213 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H60cB1B213 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H60cB1B213 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H60cB1B213 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H60cB1B213 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H60cB1B213 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H60cB1B213 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H60cB1B213 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H60cB1B213 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H60cB1B213 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H60cB1B213 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H60cB1B213 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H60cB1B213 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H60cB1B213 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H60cB1B213 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H60cB1B213 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H60cB1B213 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms