Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf25B1AWN9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf25B1AWN9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfrsf25B1AWN9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfrsf25B1AWN9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfrsf25B1AWN9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfrsf25B1AWN9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfrsf25B1AWN9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfrsf25B1AWN9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf25B1AWN9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf25B1AWN9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf25B1AWN9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf25B1AWN9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf25B1AWN9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfrsf25B1AWN9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfrsf25B1AWN9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf25B1AWN9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf25B1AWN9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf25B1AWN9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf25B1AWN9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf25B1AWN9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf25B1AWN9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf25B1AWN9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf25B1AWN9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf25B1AWN9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf25B1AWN9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf25B1AWN9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf25B1AWN9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf25B1AWN9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf25B1AWN9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf25B1AWN9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf25B1AWN9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf25B1AWN9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf25B1AWN9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf25B1AWN9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf25B1AWN9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf25B1AWN9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf25B1AWN9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf25B1AWN9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf25B1AWN9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf25B1AWN9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf25B1AWN9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfrsf25B1AWN9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfrsf25B1AWN9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms