Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Scml2B1AVB3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scml2B1AVB3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scml2B1AVB3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scml2B1AVB3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scml2B1AVB3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scml2B1AVB3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scml2B1AVB3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scml2B1AVB3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scml2B1AVB3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Scml2B1AVB3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scml2B1AVB3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scml2B1AVB3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scml2B1AVB3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scml2B1AVB3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scml2B1AVB3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scml2B1AVB3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scml2B1AVB3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scml2B1AVB3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Scml2B1AVB3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scml2B1AVB3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scml2B1AVB3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scml2B1AVB3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scml2B1AVB3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scml2B1AVB3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scml2B1AVB3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scml2B1AVB3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scml2B1AVB3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scml2B1AVB3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scml2B1AVB3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Scml2B1AVB3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scml2B1AVB3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scml2B1AVB3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Scml2B1AVB3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scml2B1AVB3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scml2B1AVB3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scml2B1AVB3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scml2B1AVB3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scml2B1AVB3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scml2B1AVB3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scml2B1AVB3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scml2B1AVB3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scml2B1AVB3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scml2B1AVB3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scml2B1AVB3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scml2B1AVB3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scml2B1AVB3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scml2B1AVB3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scml2B1AVB3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scml2B1AVB3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scml2B1AVB3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scml2B1AVB3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Scml2B1AVB3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scml2B1AVB3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scml2B1AVB3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scml2B1AVB3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scml2B1AVB3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scml2B1AVB3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scml2B1AVB3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scml2B1AVB3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Scml2B1AVB3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scml2B1AVB3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scml2B1AVB3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scml2B1AVB3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scml2B1AVB3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scml2B1AVB3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scml2B1AVB3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scml2B1AVB3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scml2B1AVB3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scml2B1AVB3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scml2B1AVB3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scml2B1AVB3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scml2B1AVB3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scml2B1AVB3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms