Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD6

Slfn9, Schlafen 9, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn9B1ARD6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn9B1ARD6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slfn9B1ARD6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slfn9B1ARD6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slfn9B1ARD6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slfn9B1ARD6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slfn9B1ARD6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slfn9B1ARD6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slfn9B1ARD6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slfn9B1ARD6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slfn9B1ARD6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slfn9B1ARD6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slfn9B1ARD6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slfn9B1ARD6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slfn9B1ARD6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn9B1ARD6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn9B1ARD6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn9B1ARD6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn9B1ARD6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn9B1ARD6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slfn9B1ARD6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slfn9B1ARD6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn9B1ARD6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn9B1ARD6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn9B1ARD6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn9B1ARD6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slfn9B1ARD6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slfn9B1ARD6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slfn9B1ARD6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slfn9B1ARD6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slfn9B1ARD6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn9B1ARD6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn9B1ARD6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn9B1ARD6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn9B1ARD6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn9B1ARD6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn9B1ARD6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn9B1ARD6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn9B1ARD6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn9B1ARD6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn9B1ARD6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn9B1ARD6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn9B1ARD6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn9B1ARD6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn9B1ARD6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfn9B1ARD6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfn9B1ARD6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn9B1ARD6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn9B1ARD6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slfn9B1ARD6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slfn9B1ARD6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slfn9B1ARD6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn9B1ARD6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn9B1ARD6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn9B1ARD6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfn9B1ARD6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfn9B1ARD6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfn9B1ARD6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfn9B1ARD6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn9B1ARD6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn9B1ARD6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn9B1ARD6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfn9B1ARD6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfn9B1ARD6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfn9B1ARD6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slfn9B1ARD6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slfn9B1ARD6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slfn9B1ARD6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slfn9B1ARD6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slfn9B1ARD6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Slfn9B1ARD6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slfn9B1ARD6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slfn9B1ARD6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slfn9B1ARD6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slfn9B1ARD6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slfn9B1ARD6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slfn9B1ARD6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slfn9B1ARD6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slfn9B1ARD6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slfn9B1ARD6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slfn9B1ARD6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slfn9B1ARD6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms