Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2dnl2A2AFH2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2dnl2A2AFH2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2dnl2A2AFH2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube2dnl2A2AFH2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube2dnl2A2AFH2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2dnl2A2AFH2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2dnl2A2AFH2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2dnl2A2AFH2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2dnl2A2AFH2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2dnl2A2AFH2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ube2dnl2A2AFH2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2dnl2A2AFH2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2dnl2A2AFH2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2dnl2A2AFH2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2dnl2A2AFH2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2dnl2A2AFH2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2dnl2A2AFH2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2dnl2A2AFH2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2dnl2A2AFH2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2dnl2A2AFH2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2dnl2A2AFH2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2dnl2A2AFH2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2dnl2A2AFH2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2dnl2A2AFH2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2dnl2A2AFH2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2dnl2A2AFH2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2dnl2A2AFH2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2dnl2A2AFH2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2dnl2A2AFH2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2dnl2A2AFH2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2dnl2A2AFH2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube2dnl2A2AFH2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube2dnl2A2AFH2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube2dnl2A2AFH2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube2dnl2A2AFH2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ube2dnl2A2AFH2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ube2dnl2A2AFH2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ube2dnl2A2AFH2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube2dnl2A2AFH2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2dnl2A2AFH2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2dnl2A2AFH2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2dnl2A2AFH2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube2dnl2A2AFH2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube2dnl2A2AFH2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2dnl2A2AFH2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube2dnl2A2AFH2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ube2dnl2A2AFH2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube2dnl2A2AFH2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube2dnl2A2AFH2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2dnl2A2AFH2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2dnl2A2AFH2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube2dnl2A2AFH2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2dnl2A2AFH2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2dnl2A2AFH2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2dnl2A2AFH2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube2dnl2A2AFH2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2dnl2A2AFH2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube2dnl2A2AFH2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms