Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fbf1A2A870 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fbf1A2A870 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fbf1A2A870 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fbf1A2A870 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fbf1A2A870 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fbf1A2A870 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fbf1A2A870 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fbf1A2A870 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Fbf1A2A870 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fbf1A2A870 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fbf1A2A870 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fbf1A2A870 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fbf1A2A870 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fbf1A2A870 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Fbf1A2A870 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fbf1A2A870 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fbf1A2A870 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fbf1A2A870 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fbf1A2A870 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Fbf1A2A870 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fbf1A2A870 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fbf1A2A870 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fbf1A2A870 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fbf1A2A870 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fbf1A2A870 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fbf1A2A870 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fbf1A2A870 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fbf1A2A870 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Fbf1A2A870 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fbf1A2A870 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fbf1A2A870 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Fbf1A2A870 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fbf1A2A870 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fbf1A2A870 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fbf1A2A870 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fbf1A2A870 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fbf1A2A870 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fbf1A2A870 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fbf1A2A870 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fbf1A2A870 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fbf1A2A870 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fbf1A2A870 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fbf1A2A870 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fbf1A2A870 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fbf1A2A870 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fbf1A2A870 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fbf1A2A870 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fbf1A2A870 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fbf1A2A870 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fbf1A2A870 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fbf1A2A870 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fbf1A2A870 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fbf1A2A870 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fbf1A2A870 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fbf1A2A870 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fbf1A2A870 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fbf1A2A870 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fbf1A2A870 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fbf1A2A870 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fbf1A2A870 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fbf1A2A870 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fbf1A2A870 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Fbf1A2A870 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fbf1A2A870 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Fbf1A2A870 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fbf1A2A870 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fbf1A2A870 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fbf1A2A870 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Fbf1A2A870 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fbf1A2A870 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fbf1A2A870 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fbf1A2A870 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fbf1A2A870 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fbf1A2A870 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fbf1A2A870 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fbf1A2A870 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fbf1A2A870 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Fbf1A2A870 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fbf1A2A870 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fbf1A2A870 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fbf1A2A870 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fbf1A2A870 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fbf1A2A870 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fbf1A2A870 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Fbf1A2A870 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fbf1A2A870 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fbf1A2A870 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fbf1A2A870 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fbf1A2A870 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Fbf1A2A870 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fbf1A2A870 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbf1A2A870 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbf1A2A870 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbf1A2A870 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbf1A2A870 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbf1A2A870 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fbf1A2A870 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fbf1A2A870 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fbf1A2A870 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms