Protein–RNA interactions for Protein: A2A447

Rhox2b, Reproductive homeobox 2B, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2bA2A447 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox2bA2A447 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox2bA2A447 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox2bA2A447 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox2bA2A447 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rhox2bA2A447 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhox2bA2A447 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox2bA2A447 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox2bA2A447 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox2bA2A447 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox2bA2A447 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox2bA2A447 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox2bA2A447 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox2bA2A447 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox2bA2A447 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox2bA2A447 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhox2bA2A447 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhox2bA2A447 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhox2bA2A447 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhox2bA2A447 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhox2bA2A447 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhox2bA2A447 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhox2bA2A447 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox2bA2A447 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox2bA2A447 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox2bA2A447 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox2bA2A447 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox2bA2A447 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox2bA2A447 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox2bA2A447 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox2bA2A447 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhox2bA2A447 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox2bA2A447 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox2bA2A447 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox2bA2A447 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox2bA2A447 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox2bA2A447 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox2bA2A447 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox2bA2A447 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhox2bA2A447 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox2bA2A447 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox2bA2A447 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox2bA2A447 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox2bA2A447 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox2bA2A447 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox2bA2A447 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox2bA2A447 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox2bA2A447 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox2bA2A447 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox2bA2A447 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox2bA2A447 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox2bA2A447 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox2bA2A447 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox2bA2A447 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox2bA2A447 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox2bA2A447 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhox2bA2A447 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhox2bA2A447 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox2bA2A447 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox2bA2A447 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox2bA2A447 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox2bA2A447 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox2bA2A447 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox2bA2A447 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox2bA2A447 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhox2bA2A447 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhox2bA2A447 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rhox2bA2A447 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox2bA2A447 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox2bA2A447 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox2bA2A447 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox2bA2A447 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox2bA2A447 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox2bA2A447 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox2bA2A447 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox2bA2A447 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox2bA2A447 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox2bA2A447 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox2bA2A447 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox2bA2A447 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox2bA2A447 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox2bA2A447 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox2bA2A447 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rhox2bA2A447 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox2bA2A447 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox2bA2A447 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox2bA2A447 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox2bA2A447 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox2bA2A447 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox2bA2A447 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox2bA2A447 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox2bA2A447 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox2bA2A447 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox2bA2A447 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox2bA2A447 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox2bA2A447 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox2bA2A447 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox2bA2A447 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox2bA2A447 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox2bA2A447 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms