Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms