Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YUD5

Nup205, Nucleoporin 205, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup205A0A0J9YUD5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup205A0A0J9YUD5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup205A0A0J9YUD5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup205A0A0J9YUD5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup205A0A0J9YUD5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup205A0A0J9YUD5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup205A0A0J9YUD5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup205A0A0J9YUD5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup205A0A0J9YUD5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup205A0A0J9YUD5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup205A0A0J9YUD5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup205A0A0J9YUD5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup205A0A0J9YUD5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup205A0A0J9YUD5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup205A0A0J9YUD5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup205A0A0J9YUD5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup205A0A0J9YUD5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup205A0A0J9YUD5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup205A0A0J9YUD5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup205A0A0J9YUD5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup205A0A0J9YUD5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup205A0A0J9YUD5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup205A0A0J9YUD5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup205A0A0J9YUD5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup205A0A0J9YUD5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup205A0A0J9YUD5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup205A0A0J9YUD5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup205A0A0J9YUD5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup205A0A0J9YUD5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup205A0A0J9YUD5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup205A0A0J9YUD5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup205A0A0J9YUD5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup205A0A0J9YUD5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup205A0A0J9YUD5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup205A0A0J9YUD5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup205A0A0J9YUD5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup205A0A0J9YUD5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup205A0A0J9YUD5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup205A0A0J9YUD5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup205A0A0J9YUD5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup205A0A0J9YUD5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup205A0A0J9YUD5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup205A0A0J9YUD5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup205A0A0J9YUD5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nup205A0A0J9YUD5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nup205A0A0J9YUD5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup205A0A0J9YUD5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup205A0A0J9YUD5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup205A0A0J9YUD5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup205A0A0J9YUD5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup205A0A0J9YUD5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup205A0A0J9YUD5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup205A0A0J9YUD5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup205A0A0J9YUD5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup205A0A0J9YUD5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup205A0A0J9YUD5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup205A0A0J9YUD5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup205A0A0J9YUD5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup205A0A0J9YUD5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup205A0A0J9YUD5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup205A0A0J9YUD5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup205A0A0J9YUD5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup205A0A0J9YUD5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup205A0A0J9YUD5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup205A0A0J9YUD5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup205A0A0J9YUD5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup205A0A0J9YUD5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup205A0A0J9YUD5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup205A0A0J9YUD5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup205A0A0J9YUD5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup205A0A0J9YUD5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup205A0A0J9YUD5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup205A0A0J9YUD5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup205A0A0J9YUD5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup205A0A0J9YUD5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup205A0A0J9YUD5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup205A0A0J9YUD5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup205A0A0J9YUD5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup205A0A0J9YUD5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup205A0A0J9YUD5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup205A0A0J9YUD5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup205A0A0J9YUD5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup205A0A0J9YUD5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms