Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU3

Trdc, T cell receptor delta, constant region (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdcA0A0G2JEU3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrdcA0A0G2JEU3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrdcA0A0G2JEU3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrdcA0A0G2JEU3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrdcA0A0G2JEU3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrdcA0A0G2JEU3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrdcA0A0G2JEU3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrdcA0A0G2JEU3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrdcA0A0G2JEU3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrdcA0A0G2JEU3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrdcA0A0G2JEU3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrdcA0A0G2JEU3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrdcA0A0G2JEU3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TrdcA0A0G2JEU3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TrdcA0A0G2JEU3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrdcA0A0G2JEU3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrdcA0A0G2JEU3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrdcA0A0G2JEU3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrdcA0A0G2JEU3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrdcA0A0G2JEU3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrdcA0A0G2JEU3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrdcA0A0G2JEU3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrdcA0A0G2JEU3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdcA0A0G2JEU3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdcA0A0G2JEU3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdcA0A0G2JEU3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TrdcA0A0G2JEU3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrdcA0A0G2JEU3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrdcA0A0G2JEU3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrdcA0A0G2JEU3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TrdcA0A0G2JEU3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrdcA0A0G2JEU3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrdcA0A0G2JEU3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrdcA0A0G2JEU3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrdcA0A0G2JEU3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrdcA0A0G2JEU3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrdcA0A0G2JEU3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrdcA0A0G2JEU3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrdcA0A0G2JEU3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TrdcA0A0G2JEU3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrdcA0A0G2JEU3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrdcA0A0G2JEU3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrdcA0A0G2JEU3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrdcA0A0G2JEU3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrdcA0A0G2JEU3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TrdcA0A0G2JEU3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrdcA0A0G2JEU3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrdcA0A0G2JEU3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrdcA0A0G2JEU3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrdcA0A0G2JEU3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrdcA0A0G2JEU3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrdcA0A0G2JEU3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrdcA0A0G2JEU3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrdcA0A0G2JEU3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrdcA0A0G2JEU3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrdcA0A0G2JEU3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrdcA0A0G2JEU3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrdcA0A0G2JEU3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrdcA0A0G2JEU3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TrdcA0A0G2JEU3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrdcA0A0G2JEU3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrdcA0A0G2JEU3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrdcA0A0G2JEU3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrdcA0A0G2JEU3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrdcA0A0G2JEU3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrdcA0A0G2JEU3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrdcA0A0G2JEU3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrdcA0A0G2JEU3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrdcA0A0G2JEU3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TrdcA0A0G2JEU3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrdcA0A0G2JEU3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrdcA0A0G2JEU3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrdcA0A0G2JEU3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrdcA0A0G2JEU3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrdcA0A0G2JEU3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrdcA0A0G2JEU3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrdcA0A0G2JEU3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrdcA0A0G2JEU3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrdcA0A0G2JEU3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrdcA0A0G2JEU3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrdcA0A0G2JEU3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrdcA0A0G2JEU3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrdcA0A0G2JEU3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms